先天性胆总管囊肿一般来讲分5种类型，不同的类型可能有不同的治疗方式。

　　1型的先天性胆管囊肿，一般要把囊肿完整的切除，切除之后需要将正常部位肝胆管与空肠进行吻合，就是空肠Roux-Y的吻合，使胆汁进一步的引流。如果有癌变，可能需要做胰十二指肠切除。

　　2型的先天性胆总管囊肿往往要做相应的治疗，要把胆总管囊肿要切掉。另外2型一般都存在胰胆管合流的异常，要把胆囊切掉。有的时候要做胆管，也要改道，要做Roux-Y的吻合。

　　3型的先天性胆总管囊肿是脱垂型的，一般可以做ERCP，把远端的囊肿切开引流。

　　4型的先天性胆总管囊肿手术方式和1型基本相似。

　　5型先天性胆管囊肿如果是局限性的，可能需要切除肝脏。如果是弥漫型的，存在肝功能不全的情况，尤其是小孩或者青年人，可能需要做肝移植手术。