绝大部分的川崎病都是预后良好的,通过治疗孩子可能不留任何的后遗症。只有极少一部分的孩子由于冠状动脉扩张形成冠状动脉瘤,同时也发生冠状动脉的狭窄,出现栓塞的情况。可能会诱发心肌梗塞或者其他比较严重的情况,但是这一部分的情况是比较少。
孩子可以发生在随诊的过程中,通过彩色心脏、多普勒超声检查,可以及时的发现。绝大部分的孩子在随访一到两年以后完全治愈。