药流后肚子疼可能是子宫收缩引起的，也可能是感染因素、药流不全等因素导致的，需要明确原因进行对症治疗。
1、子宫收缩：药物流产后妊娠囊已经排除宫腔，但宫腔内还会有淤血，从而使子宫收缩，促进宫腔内淤血排出，这时就会出现肚子疼。通常不需要特殊的处理，药流干净以后，疼痛会逐渐消退。
2、感染因素：药流以后如果不注意个人卫生容易引起感染，从而会导致肚子疼痛，同时还会伴有白带增多、发热等情况。需要及时在医生指导下服用消炎药物治疗，比如妇科千金片、富平胶囊宫炎平片等药物。
3、药流不全：药物流产以后，如果流产不全，宫腔内有残留的组织物，会刺激子宫引起子宫平滑肌收缩，从而导致药流后肚子疼，同时还会伴有阴道流血的情况。可以遵医嘱服用益母草颗粒、新生化颗粒、血府逐瘀口服液等药物治疗，必要时需要进行清宫手术。