左手小指第二关节痛的原因有很多，如指关节韧带拉伤、指骨骨折、类风湿关节炎等。

1、指关节韧带拉伤：主要原因为手指过度活动导致关节周围韧带拉伤，可因拉扯重物、打篮球、摔倒后手撑地等原因导致，部分患者表现为左手小指第二关节疼痛肿胀，活动后疼痛加剧。

2、指骨骨折：小指骨质较细，容易在外力的作用下骨折，如患者有外伤史，如摔伤、打击伤等，可造成左手小指骨骨折而引发第二关节疼痛，具体表现为小指活动受限、肿胀畸形，可伴有局部瘀血、瘀斑等。

3、类风湿关节炎：是一种慢性全身性自身免疫性疾病，其特征是手、足小关节的多关节、对称性、侵袭性炎症，经常伴有关节外器官受累及血清类风湿因子阳性，具体表现为小指关节僵硬疼痛，早上起床时僵硬程度加重，伴有小指关节周围红肿，通常为双侧对称发病，也可导致左手小指第二关节痛。