哺乳期晚上咳嗽厉害可能是上呼吸道感染、气管支气管炎、咳嗽变异性哮喘等导致，因为处于哺乳期，主要采取不会经乳汁分泌的药物治疗，具体如下：

1、如果是上呼吸道感染所导致，临床表现除了咳嗽外主要还有高热 、寒战、头痛、乏力、食欲减退、全身肌肉酸痛等全身中毒症状，还可表现为为呕吐、腹泻、腹痛等。治疗上应卧床休息，多饮水，隔离传染源、加强锻炼、增强体质、改善营养、饮食生活规律、避免受凉和过度劳累有助于疾病好转，咳嗽严重时可以使用布地奈德雾化吸入治疗；

2、如果是气管支气管炎所导致，其临床表现主要为咳嗽、咳痰或伴有喘息，治疗主要是抗生素如头孢呋辛、阿莫西林、阿奇霉素等消炎治疗，治疗过程中监测母乳喂养的婴儿是否存在腹泻、呕吐或皮疹，如有上述症状应立即停药；

3、如果是咳嗽变异性哮喘所导致，临床表现主要为长期顽固性干咳，常常在吸入刺激性气味、冷空气、接触变应原、运动后诱发，部分患者没有任何诱因，多在夜间或凌晨加剧，有的患者发作有一定的季节性，以春秋为多。治疗需要吸入用糖皮质激素如布地奈德，也可以使用支气管扩张药物硫酸特布他林吸入治疗，对于停药后又反复发作的患者应及时就诊查清过敏原，采取有效的预防手段。

注意：哺乳期以上相关用药须谨慎，应在医师指导下使用。