大腿内侧有囊肿可能是血肿、皮脂腺囊肿、脂肪瘤等原因导致的，具体分析如下：

1、血肿：当大腿内侧受到剧烈的撞击伤时，由于腿部内侧的血管丰富，当出现破裂出血，血液积存在皮下，进而出现了一个较大的血肿，血肿未吸收完全时，表现为大腿内侧包块，柔软，类似囊肿。

2、皮脂腺囊肿：主要是由于局部皮肤油脂过度分泌，导致皮肤的皮脂腺导管阻塞，内容物积聚所引起的囊肿。当发生在大腿内侧多数生长缓慢，未合并感染时，患者一般无自觉症状。因囊肿高出皮面，运动时经过摩擦易继发感染，可能出现红、肿、热、痛炎性反应，炎性渗出。

3、脂肪瘤：发生于任何有脂肪组织皮下的一种良性肿瘤，多见于成人，病因暂不明确，可能与饮食因素过度饮酒、进食过多油腻，压力因素如工作压力过大，不良生活习惯如长期熬夜，这些原因会影响脂肪代谢，通常会发现在皮下有一个或者多个的肿块，于颈部、肩部、背部、腹部、四肢近端(如上臂、大腿、臀部)，瘤体表面覆盖皮肤多正常，瘤体质地有弹性感，若脂肪瘤长在大腿内侧，逐渐增长，会形成类似于囊肿的东西。