肛瘘手术后有大量分泌物，可能是由于炎性分泌物、大便污染、未彻底切除内口等原因引起的，应该根据不同的病因选择不同的治疗措施。

1、炎性分泌物：由于肛瘘手术是一种将瘘管切开或者完全切除并冲洗的手术，术后一般不缝合，每日做好切口消毒，使切口周围肉芽组织缓慢填充至切口内，使切口恢复。脓腔壁上的炎性物质在术后换药的过程中逐渐流出，因此出现异味的液体。这种情况是正常的，不必过多担心，只需做好每日的伤口清洁、消毒，炎性物质可逐渐消失。如果炎性物质过多，可在专业医师指导下使用头孢西酮钠、甲硝唑、左氧氟沙星等抗生素，同时清淡饮食，禁止吃辛辣刺激性食物等。

2、大便污染：肛瘘一般发生在肛门周围，并且由于肛瘘内口通直肠，排便时若是大便未成型，大便容易从内口流至手术切口，使切口流出大量分泌物。若是处于住院期间，排便后大便污染切口，可自行洗净，再找管床医生切口换药；若是出院后大便污染切口，可自行洗净切口的大便，并且使用高锰酸钾温水坐浴10分钟左右，保持切口的清洁。手术治疗期间合理控制饮食，多吃水果蔬菜，禁止抽烟喝酒等。

3、未彻底切除内口：复杂肛瘘可出现两个以上内口，手术中若未将其彻底切除，残余内口可反复发生炎症，并且由于残余内口与手术切口相通，产生大量渗出物质沿着瘘管留至切口处，使手术切口出现大量分泌物。治疗上应该以手术为主，彻底将残余内口清除，术式可选择肛瘘切除术、挂线疗法等。并且术后每日高锰酸钾温水坐浴，合理控制饮食，多吃水果蔬菜，避免便秘、腹泻等。