肛瘘术后使用碘伏消毒，不会影响伤口愈合。碘伏是临床常用的一种消毒物品，可以杀灭金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、白色念珠菌等多种致病微生物，在手术后，使用碘伏进行消毒，可以预防伤口出现感染。

肛瘘是指肛管或直肠与会阴皮肤相通的慢性、感染性通道，多发生于肛周脓肿溃破后，由内口、瘘管、外口三部分组成。一旦临床确诊后，需要及时手术治疗，根据肛瘘的性质选择合适的手术方式，如低位肛瘘，选择肛瘘切开术；有内外口的低位肛瘘或高位单纯性肛瘘，选择挂线疗法。在手术后，需要遵从医嘱做好个人护理，保持伤口清洁卫生，在术后可以使用碘伏进行消毒，或者在医生指导下口服抗生素药物，如头孢克肟分散片、头孢拉定胶囊、青霉素V钾片等药物，以预防伤口出现感染。或者口服草木犀流浸液片、迈之灵片、地奥司明片等药物，促进微循环，促进伤口愈合。

在手术后，生活中也需要养成良好排便习惯，排便后使用温水或低浓度高锰酸解溶液坐浴，保持肛门清洁。适当进行体育锻炼，避免久坐、熬夜、劳累等。饮食上避免进食辛辣、油腻、寒凉性的食物，多吃新鲜水果、蔬菜。