药物性流产可以流干净。

药物流产不干净的因素：第一、患者体质；第二、与孕囊大小相关。特别是对于有保胎治疗，再行药物性流产，流产不干净的可能性会更大。一般情况下，大约有1/3以上的女性，会出现药物性流产不干净的情况。如果药流不干净，可以直接行清宫手术，最好是在宫腔镜直视下行清宫，盲目刮宫，可能会刮不干净，需要再次手术，对患者的伤害会比较大。多次清宫术会使宫腔粘连，子宫内膜受损，造成日后不孕。

所以药流的女性要根据怀孕时间，有没有长期吃雌、孕激素药物，之前有没有保胎治疗等情况来选择，这些都可能会影响药物流产的结局。