大便标本的采集，通常是采用自然排出的大便。应注意以下事项：

一、要用干燥清洁的容器留取新鲜标本，不得混有尿液或其他物质，如果做细菌学检查，更应将标本放入加盖的无菌容器内立即送检；二、粪便标本有脓血时，应挑出有脓血及黏液的部分涂片送检，外观无异常的粪便要多点取样检查；三、对某些寄生虫及虫卵的初筛检测，应采取三送三检，因为许多肠道原虫和某些蠕虫卵都有周期性排出的现象；四、从粪便中检测阿米巴滋养体等寄生虫原虫，应在收集标本后三十分钟内送检，并注意保暖；五、粪便隐血检查，病人应素食三天，并禁服铁剂及维生素C，否则易出现假阳性；六、无粪便又必须检测时，可经肛门指诊采集粪便。