眼睛长疖子是可以用牛黄上清丸的。

当眼睛周围的皮肤组织受到金黄色葡萄球菌等病原体的感染之后，在炎性物质的刺激之下就会有疖子长出，通常表面发红肿胀，可伴有疼痛感。疖子内部后期还可出现脓性分泌物，进而形成脓包。

牛黄上清丸属于中成药物，主要由牛黄、黄连、黄柏、发黄、栀子等药物制成，具有清热泻火、祛风止痛的功效，在临床上主要用于头痛眩晕、牙龈肿痛、口舌生疮等情况。眼睛长疖子的患者在服用牛黄上清丸后，患处的炎症反应通常可以有所减轻，红肿疼痛的症状能够得到好转，对于改善病情是有好处的。牛黄上清丸需要在医生的指导下服用，建议患者不要自行盲目用药。

同时建议做好患处的清洁工作，可适当进行热敷改善症状。可外用左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、红霉素眼膏等药物局部抗感染治疗。