男孩16岁还没发育一般是有问题的，考虑发育迟缓，建议到医院检查性激素及骨龄等相关检查协诊。男孩16岁不出现第二性征发育可称青春期性发育迟缓。性发育迟缓是指性征的出现与性征的发展不正常。儿童在青春发育年龄范围而未出现第二性征表现者，或虽出现第二性征，但进展非常缓慢，均为青春期发育迟缓表现。可能与营养不良、甲状腺功能低下、鞍区病变有关，具体如下:

1、营养不良：长期营养摄入不足不仅会导致体重显著低于正常均值，皮下脂肪层菲薄，厌食表现，最终还会影响身高，免疫力。青春期发育孩子要加强营养，多食用牛奶、鸡蛋等蛋白质含量高的食物，还需要加强锻炼，增强体魄。

2、甲状腺功能低下：甲状腺功能低下患儿通常会导致发育迟缓。甲状腺激素低的患儿，一般可能导致其机体内的甲状腺激素减少，可以使患儿出现食欲不振，全身代谢降低、发育迟缓、乏力等症状。

3、鞍区病变：鞍区病变一般指的是垂体病变，垂体是脑内重要的内分泌腺体，包括腺垂体和神经垂体两个部分。鞍区病变引起者，可以伴其他垂体功能减低，出现生长发育迟缓等表现，需要去正规医院完善头颅影像学检查。