肛瘘最佳治疗方法通常为手术治疗。

肛瘘为一种特殊类型的肛周疾病，多为肛门直肠脓肿破溃或切开引流后形成的迁延不愈的管腔。腔道周围可见疤痕组织，形成慢性感染性管道即肛瘘，通常药物治疗对肛瘘的病情恢复没有明显的疗效，只有通过手术治疗才能有效治疗肛瘘病情。

肛瘘按肛管与括约肌的关系将肛瘘分为4类，分别为约肌间肛瘘、经括约肌肛瘘、括约肌上肛瘘、括约肌外肛瘘。检查方式包括肛门指诊、探针探查、瘘管造影、肛管超声、MRI检查等。治疗方式以手术治疗为主，术式包括挂线疗法、肛瘘切开术、肛瘘切除术、肛瘘切除后植皮、瘘管切开加挂线疗法等。术后需做好切口周围局部的清洁卫生，可温水坐浴及冲洗，需在医生指导下使用抗生素预防感染，如注射用头孢唑林钠、盐酸左氧氟沙星注射液等。