肠白塞病的治疗主要是给予对症治疗，其他还有眼炎治疗、血管炎治疗几个方面，然而任何一种治疗都不能取得根治的效果。内脏系统的血管炎，主要是运用糖皮质激素和细胞毒药物治疗。肠白塞病也可以选择糖皮质激素和细胞免疫抑制剂治疗。糖皮质激素常用的有可的松、氢化可的松、泼尼松等。免疫抑制剂常选用硫唑嘌呤、环磷酰胺、甲氨蝶呤、环孢素等。

肠白塞病可引起溃疡出血、穿孔、肠漏、吸收不良、感染等严重并发症，死亡率可达10%。

白塞病是一种以口腔溃疡、外阴瘙痒、眼炎及皮肤损害为临床特征，累及多个系统的慢性疾病，病情呈反复发作和缓解的交替过程。有部分患者因局部血管炎引起内脏病变，消化道因多发性溃疡而出现腹痛等症状，重症患者有肠出血、肠麻痹、肠穿孔、瘘管形成等。