小肚子隐隐约约的不舒服原因很多，常见的有胃肠道功能紊乱、慢性肠炎、肠梗阻等。

1、胃肠道功能紊乱：情绪紧张、焦虑、压力大等，均可影响胃肠功能正常活动，引起胃肠道功能紊乱。此病大多起病缓慢，病程常经年累月，呈持续性或有反复发作，为胃肠道最常见的功能性疾病。在饮食不洁、进食冷饮或压力大时就会表现为腹痛、腹胀或小肚子隐隐约约不舒服。

2、慢性肠炎：由细菌、病毒、真菌和寄生虫等引起的肠道慢性炎症性疾病，肠道在饮食不洁或受到感染刺激时会产生慢性、反复性的疼痛，伴有腹泻及消化不良等，可以感觉到小肚子隐隐约约的不舒服。

3、肠梗阻: 各种原因引起的肠内容物通过障碍统称肠梗阻，由于肠内容物无法顺利通过，引起梗阻部位以上强烈肠蠕动，或肠壁缺血坏死，早期可以感觉到小肚子隐隐约约的不舒服，随着病程发展可出现阵发性腹痛，伴恶心、呕吐、腹胀等症状。