耳朵用棉签掏了一下里面痛，可能是棉签导致外耳道皮肤破损、鼓膜穿孔等情况，但也不排除本身患有中耳炎等情况所导致的疼痛，需要根据具体情况采取处理措施。

1、外耳道皮肤破损：若在掏耳朵的过程中不慎将外耳道皮肤戳破，常可引起耳内疼痛、皮肤红肿，甚至有少许渗血等表现，故可见耳朵用棉签掏了一下里面痛的现象。此时需停止不当的掏耳行为，并保持外耳道的干燥、清洁，避免进入脏水等以污染伤口引起感染等。此时需在医生指导下外用莫匹罗星软膏、红霉素软膏以及盐酸金霉素软膏等药物。

2、鼓膜穿孔：若掏耳朵时掏的深度过深，就可能直接损伤到鼓膜使其穿孔，患者常有突发的耳痛、耳鸣以及听力下降等表现，故可见耳朵用棉签掏了一下里面痛的现象。此时需清理外耳道残存的异物或凝血块等，不可用力擤鼻，以免造成更为严重的穿孔；同时外耳道需保持干燥，不可予以外耳道冲洗、滴药等操作。穿孔较小的一般在一段时间后可自行愈合；穿孔较大或穿孔无法愈合者需考虑行鼓膜修补术等；若患者有明显的疼痛时，可遵医嘱使用布洛芬、酚咖片、对乙酰氨基酚等药物进行止痛。

3、中耳炎：患者因鼓膜穿孔进水、鼻部炎症以及长期塞耳塞等原因累及中耳而导致的炎症。患者本身存在耳痛、耳流脓、鼓膜穿孔以及听力下降等表现。若在掏耳朵过程中操作不当，可能使疼痛更为剧烈，故可出现耳朵用棉签掏了一下里面痛的现象。治疗上，可在专业医生的指导下予以氧氟沙星滴耳液、氯霉素滴耳液、盐酸左氧氟沙星滴耳液等；同时还可口服头孢呋辛酯片等药物治疗。对于鼓膜穿孔较大，影响听力者，可行鼓膜修补术或鼓室成形术等。