长期服用倍他司汀，部分患者会出现副作用，可能会出现心血管系统的不良反应，如偶有心悸，但对血压、心率影响小，还有神经系统的副作用，如偶有头痛、头晕、头胀、疲劳、困倦、嗜睡、失眠等，还可能有胃肠道反应，可有口干、恶心、呕吐、食欲缺乏、胃部不适、腹痛、腹泻、消化性溃疡的加重等。

倍他司汀是神经科最常用的药物之一，常见的片剂主要有甲磺酸倍他司汀片、盐酸倍他司汀片。甲磺酸倍他司汀针对性改善循环， 能特异性增加大脑、脑干内血液循环及内耳微循环,，消除内淋巴水肿，主要用于各种疾病引起的头晕和眩晕，治疗效果显著。

而盐酸倍他司汀对脑血管、心血管，特别是对椎底动脉系统有较明显的扩张作用，主要用于治疗梅尼埃综合征、血管性头痛及脑动脉硬化，并可用于治疗急性缺血性脑血管疾病，如脑血栓、脑栓塞、一过性脑供血不足等疾病。