导致婴儿低血氧症的病因比较多，比如呼吸系统疾病、心脏系统疾病、中枢神经系统疾病、气道梗阻等等：

一、呼吸系统疾病，比如严重的肺炎、呼吸窘迫综合征、肺出血等等；二、心脏系统疾病，比如先天性心脏病、心肌病、心律失常等；三、中枢神经系统疾病，比如严重缺氧缺血性脑病或者颅内出血，导致中枢性呼吸功能障碍，会导致血氧饱和度降低；四、气道梗阻，比如先天性会咽囊肿、气道狭窄、后鼻孔闭锁等等，也会出现血氧饱和度降低。