肛门有一边像肿了一样有点疼，可能是肛门尖锐湿疣、痔疮、肛周脓肿等疾病引起的，应该根据不同病因采取不同的治疗措施，具体如下：

1、肛门尖锐湿疣：是感染人类乳头瘤病毒引起的肛门皮肤增生性疾病。肛门尖锐湿疣常常在肛周形成一个至多个针尖至黄豆大小的粉红色丘疹，若是人类乳头瘤病毒入侵肛门皮肤面积过大，引起巨大型损害又称巨大型尖锐湿疣，生长迅速形成外观为菜花状或疣状的包块。如长于肛门一边并且伴感染就可出现肛门有一边像肿了一样有点疼的症状。治疗上应该以手术治疗为主，术式为巨大尖锐湿疣切除术。另外，对于较小的尖锐湿疣，还可在专业医师的指导下使用咪喹莫特乳膏、斑蝥素乳膏等外敷药物治疗，或者用冷冻、电凝治疗。另外尖锐湿疣是一种性传播疾病，其性伴侣也应该同时治疗，以避免交叉感染。

2、痔疮：如发生血栓性外痔、内痔脱出并发生栓塞、感染等使得痔疮水肿变大，就可出现肛门有一边像肿了一样有点疼的症状。痔疮除表现出包块外，还可表现为剧烈疼痛、出血、排便困难、肛门不适、瘙痒不洁等。若是无症状或者症状较轻的痔疮可采取保守治疗如健康饮食，多吃水果蔬菜，软化大便，禁止吃辛辣刺激食物等，每日温水坐浴，改善循环，合理控制排便时间等。另外还可使用痔疮膏、痔疮栓等药物。对于症状较重的内痔，可以考虑手术治疗，术式可选择痔单纯切除术、吻合器痔上黏膜环切钉合术等。

3、肛周脓肿：指的是直肠肛管周围软组织或其周围间隙发生化脓性感染，使脓腔形成。若脓腔发生于肛门一侧，可出现肛门有一边像肿了一样有点疼的症状。肛周脓肿的其他临床表现还可有肛周持续性跳痛，病变处红肿、硬结、压痛，痔疮坠胀感，排便不尽，发热、寒战、乏力等全身症状。对于症状较轻的肛周脓肿可选择单用对革兰阴性杆菌有效的抗生素，如头孢呋辛钠、头孢克洛、头孢西酮钠等，每日温水坐浴保持肛周清洁，多吃香蕉、苹果、菠菜、芹菜等助消化的水果蔬菜，禁止吃辛辣刺激食物等。若症状较重的肛周脓肿应考虑手术治疗，如肛门周围脓肿切开引流术、骨盆直肠间隙脓肿切开引流术等术式。