治疗疱疹病毒主要是使用抗病毒的药物，抗感染的药物进行治疗。

临床常见的疱疹病毒主要是两大类，一大类是单纯疱疹病毒，可以造成口唇部位的单纯疱疹，以及生殖器部位的生殖器疱疹，另外一类是由水痘带状疱疹病毒感染所导致的水痘或者是带状疱疹。无论是单纯疱疹还是带状疱疹，这两种病毒都属于DNA病毒，可以使用抗DNA病毒的药物来进行对症治疗，比方临床常用的阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦、更昔洛韦等，对于一些耐药菌株，还可以选择膦甲酸钠来进行抗病毒的治疗，皮损的局部可以使用一些抗感染的药物，像阿昔洛韦软膏、莫匹罗星软膏、金霉素眼膏、炉甘石洗剂来进行对症处理。