幽门螺旋杆菌的检查方法主要分为侵入性和非侵入性方法。

侵入性检查方法一般是在做胃镜检查时，取胃部的一小块组织，通过快速尿素酶法测定所取组织的尿素酶含量，还可通过显微镜下直接观察组织是否存在幽门螺旋杆菌感染。非侵入性检查方法主要是尿素呼气试验方法或血清学试验方法。尿素试验方法包括碳14或碳13尿素呼气试验，是临床上应用最广泛的方法，准确性相对较高，操作方便，耐受性比较好。检查者空腹口服尿素碳14胶囊，静坐25分钟后，用一次性吹气管向二氧化碳收集剂中吹气，吹完气的样品交给医生检测就可以。