发热、咳嗽、咳痰等症状不能判断是病毒感染还是细菌感染，因为引起这些症状的原因有很多，比如上呼吸道感染、急性支气管炎、肺炎、肺结核等。如果需要确诊，需要根据主要症状、血常规、病毒检测、痰培养等进行综合判断。

1、如果刚开始有发热、鼻塞、流涕、咽干、咽痛，轻微咳嗽，多为上呼吸道感染，多是由病毒感染引起。通过血常规、病毒检测、胸部X线片等可以确诊。上呼吸道感染中还有一个特殊的疾病流行性感冒，此病以发热、头痛、肌肉痛、轻微咳嗽、有痰等为主要症状，仍然需要血常规、病毒检测、胸部X线片等确诊。

2、如果以咳嗽、咳痰为主要症状，伴有发热等，可能为细菌感染导致，如急性支气管炎、肺炎、肺结核等。血常规、胸片、痰培养等可以明确诊断。

3、病毒感染久治不愈或者免疫功能低下患者往往会继发细菌感染，需要借助血常规、病毒核酸检测以及胸片等综合诊断，随后确定治疗方案。