拔牙后牙洞有黑色腐肉，可能是生理性因素引起的，也可能炎症感染或根脓肿，还可能是干槽症引起的，具体如下：

1、生理反应：拔牙后牙槽窝出现黑色肉是由于周围组织坏死引起的，属于正常现象，一般3至4天可自行脱落，为了防止出血和感染，可以预防性的在医生指导下服用抗生素类药物，如苄星青霉素、阿莫西林、苯氧乙青霉素等来抗感染治疗。

2、出现炎症感染或根脓肿：若是在一周后仍有黑色腐肉，同时伴有口臭、牙龈周围组织红肿热痛等情况，可能会是出现感染或者根脓肿，建议可以到医院的口腔科或者是拔牙的医生处就诊，在局麻下用双氧水的小棉球进行反复擦拭，将骨壁上的腐败、坏死物质去除，然后再填塞碘仿纱条，防止耽误病情。

3、干槽症：若是拔牙后，在暴露的拔牙窝骨壁呈灰黑色，而且有可以看到黑色腐肉以及可以闻到臭味，在触碰的时候有明显的疼痛，则可能是干槽症。干槽症的治疗一定要去除里面的全部感染以及坏死物质，搔刮拔牙窝，然后用双氧水以及生理盐水反复的冲洗，直到有血液充满全部的拔牙窝，不再空虚，必要时也可以放引流条。