流鼻涕耳朵疼，主要考虑与急性鼻炎、急性中耳炎、咽鼓管炎等疾病有关，具体治疗需根据病因对应处理。具体如下：

1、急性鼻炎 ：是由病毒、细菌、过敏原（如花粉）、各种理化因子（如刺激性气体）以及某些全身性疾病引起的鼻腔黏膜炎症，主要表现为鼻塞、鼻痒、流鼻涕、打喷嚏等症状。当鼻炎未得到有效治疗，当炎症进入到咽鼓管处，从而引起中耳炎，因此会出耳朵疼痛，严重的还会影响听力。这种情况建议应用抗生素进行抗感染治疗，比如口服头孢地尼、头孢克肟、左氧氟沙星等，必要时可静脉给药，比如头孢唑肟钠 、左氧氟沙星等；若是症状严重者，建议使用糖皮质激素抗炎治疗，比如甲泼尼龙、地塞米松、倍他米松等。

2、急性中耳炎：主要考虑是急性上呼吸道感染后，炎症向咽鼓管蔓延，引起咽鼓管咽口以及管腔黏膜出现充血、肿胀，使纤毛运动发生障碍，从而引起中耳炎，因此出现流鼻涕、耳朵疼的症状。治疗上可外用醋酸曲安奈德氯霉素溶液、盐酸左氧氟沙星滴耳液、氧氟沙星滴耳液等，也可以配合应用抗生素，比如罗红霉素、阿莫西林、头孢地尼等；若出现鼓膜大穿孔，而影响到听力，可以行鼓膜修补术或者鼓室成形术。

3、咽鼓管炎：是由于上呼吸道感染，从而引起管道内黏膜肿胀，导致管腔堵塞，使外界的空气无法进入到中耳腔，而腔内原有的空气被吸收，并且逐渐形成相对负压，从而产生液体，诱发中耳炎，因此出现流鼻涕、耳朵疼的症状。治疗上主要是控制上呼吸道炎症，建议服用抗生素治疗，比如阿莫西林、头孢丙烯、左氧氟沙星等，同时多喝水，加快新陈代谢，促进疾病的康复。