肚子不舒服需要针对病因选择不同的用药。

如果是上腹痛，主要见于慢性胃炎、胃食管反流病、消化性溃疡、胃部肿瘤，如胃癌、胃淋巴瘤等，还可以是肝胆脾胰疾病或者是横结肠炎、横结肠癌。如果是脐旁或者脐两侧疼痛，可以是输尿管结石、结肠炎、结肠癌。如果是右下腹痛，可以是急性阑尾炎、肠结核、克罗恩病、输尿管结石、结肠癌、附件炎等。如果是左下腹痛，可以是直肠炎、溃疡性结肠炎、直肠癌、附件炎、输尿管结石等。

如果是慢性胃病，可以选择PPI类药物、H2受体阻滞剂、胃粘膜保护药、促胃肠动力药和助消化药等治疗。如果有幽门螺杆菌感染，可以选择四联方案根除幽门螺杆菌治疗。如果是肠结核必须抗结核治疗。炎症性肠病可以选择水杨酸类药物、糖皮质激素、细胞免疫抑制剂治疗。急性阑尾炎、附件炎、尿道炎，可以选择头孢或左氧氟沙星、甲硝唑等治疗。胃肠道肿瘤必须手术治疗，如果不能手术可以选择放疗或者是化疗。