通常来说，输卵管囊肿在3cm以内相对不严重，但是如果囊肿增大到5-6cm，可影响生育功能，甚至可引起癌变，这种情况就比较严重了。

输卵管囊肿是输卵管受病原体感染以后，由于白细胞的浸润而形成内膜肿胀、间质水肿、渗出，输卵管黏膜上皮脱落，如果输卵管急性期炎症未得到及时有效的治疗，炎症使输卵管伞端和峡部粘连，炎性分泌物无法排出，积存而形成输卵管积脓。输卵管积脓在炎症消退后，脓液逐渐被吸收，腔内积液由脓性变为浆液性，从而形成输卵管囊肿。具体分析如下：

如果输卵管囊肿在3cm以内，一般不严重，患者可无明显症状，部分患者阴道可排出黄色水样的液体，一般没有臭味，排出液体量不一，通常为间歇性排液，还有部分患者会出现阴道不规则的少量流血。输卵管囊肿较小通常不影响输卵管的功能，只需要动态复查B超，如果在动态观察过程中，发现囊肿生长比较快，则需要考虑手术治疗。

如果输卵管囊肿增长到一定的程度，如长到5-6cm，患侧下腹部可出现钝痛或者阵发性的绞痛，阴道大量液体排出后疼痛会缓解；患者的下腹部可触及实质性及囊性的包块，表现为腊肠样或不规则形状，易出现轻触痛和活动受限的情况，进行排液后肿块则会缩小，但液体积聚后又会重新增大。输卵管囊肿增长到一定程度，可能会导致输卵管本身扭转，或者整个子宫附件扭转；输卵管囊肿过大还会引起输卵管拾卵功能障碍，可能会压迫到输卵管腔，会引起输卵管粘连、堵塞，破坏输卵管的正常生理功能，从而导致继发不孕、宫外孕、甚至癌变。此时比较严重，建议及时行手术治疗。