奥硝唑和甲硝唑属于同一类药物，均属于硝基咪唑类的抗生素，抗菌谱基本相同，均可用于治疗女性的滴虫性阴道炎或厌氧菌感染，因此只要是对症用药，药物的选择和使用通常问题不大，二者的疗效是基本一致。但是针对于副作用方面，奥硝唑是第三代硝基咪唑类衍生物，与甲硝唑相比副作用会小一些，多数的女性用药之后并不会出现明显的胃肠道反应，但是使用甲硝唑后可能会出现恶心呕吐等不适的现象，所以对于口服用药考虑甲硝唑，而静脉给药考虑奥硝唑，能够最大程度地减少女性恶心呕吐的不良反应，两种药物的栓剂通常抗微生物作用的机理基本一致。

另外，女性在治疗妇科疾病期间要清淡饮食，忌辛辣刺激性的食物，多吃新鲜的蔬菜水果，保持规律的作息习惯 ，避免熬夜，并且要严格禁止性生活。