结肠炎的治疗，主要是要针对不同的病因，选择不同的药物进行治疗。

如果是急性的结肠炎，因为是有病毒或者是细菌感染引起，可以通过血常规去判断。如果血常规提示白细胞升高、中性粒细胞升高就是细菌感染，可以选择头孢或左氧氟沙星进行消炎治疗，只要经过有效的抗菌、消炎治疗之后，症状就可以迅速的缓解；如果血常规是正常的，就是病毒性引起的急性肠炎，主要是选择对症治疗，可以使用解痉药止痛和用黄连素、益生菌、蒙脱石散等进行止泻，并且患者要清淡饮食，不要进食油腻食物，煮菜的时候不要放太多油。

如果是慢性结肠炎，主要是包括溃疡性结肠炎和克罗恩病，这类肠炎主要是要通过肠镜检查明确诊断，然后选择水杨酸类药物，或者是糖皮质激素、细胞免疫抑制剂进行治疗，因为这类病有反复发作，终身反复的可能，所以患者要长期吃药，至少吃两年以上的药，有些患者需要终身维持治疗。