发烧伴有喉咙痛，可以先口服药物来进行治疗。首选的药物是青霉素类或者头孢菌素类的药物，如阿莫西林、头孢呋辛、头孢地尼等等。同时还可以口服抗厌氧菌的药物，例如甲硝唑。如果是由于病毒感染引起的，还需要口服抗病毒的药物，例如抗病毒口服液，VC银翘片等等。如果患者发热呈高热的状态，上述药物可以采用静脉输液的方法。

如果三天之后症状没有明显的好转，一定要更换抗生素。也可以取咽喉部的分泌物，来进行微生物的培养及药敏试验。根据药敏试验的结果，选用敏感的抗生素来进行抗感染治疗。

总之，如果患者发热伴有喉咙痛，建议还是要及时的于正规医院就诊，在专科医生的指导下完善相关的检查，并给予相应的治疗。