右心系统的血栓来源于下肢的深静脉，可以通过引起急性的肺栓塞，表现为突发性的胸痛、胸闷、呼吸困难。如果发生急性肺动脉栓塞，需要急诊行溶栓治疗，必要时行手术取栓，挽救生命。可以在体外循环下，先手术治疗。

左心系统的血栓主要来源于左心房，常见于二尖瓣狭窄。如果打算近期行二尖瓣置换手术，可以同时手术一并取出栓子，消除血栓。如果近期没有手术打算，可以口服华法林进行抗炎治疗，消除血栓。避免血栓脱落而引起的动脉栓塞或者脑部栓塞，引起严重的并发症。

心脏血栓主要为右心系统的血栓和左心系统的血栓。