甲状腺手术后主要的并发症有以下几个方面：第一、出血，甲状腺血供丰富，如果止血不确切，容易出现术后的继发出血；第二、呼吸困难和窒息，原因有包括创面出血压迫，气管软化、喉头水肿、双侧的喉返神经损伤；

第三、甲状旁腺的损伤可以引起血钙的降低，导致低钙的抽搐；第四、神经损伤，一侧的喉返神经损伤可能引起声音嘶哑，而双侧的喉返神经损伤则会导致呼吸困难窒息并且死亡，喉上神经的外支损伤可以引起音调的降低，内支的喉上神经损伤可以引起饮水的呛咳；第五、甲状腺功能减退；

第六、如果是甲亢的患者手术前准备不充分，容易引起甲亢危象，表现为高的脉搏系数、呕吐、精神方面的症状，病情相对比较危重；第七、如果是肿瘤手术，良性肿瘤存在复发的机会，恶性肿瘤除了复发还有转移的可能。