埋线双眼皮的弊端在于会对局部的皮肤组织造成伤害，而且并不适用于所有的求美者。

埋线双眼皮是用特制的线人为的制造出眼皮的皱褶，而出现双眼皮的效果。由于是有创的操作，术后伤口可能会发生感染的情况，还会有渗血、渗液和红肿、疼痛的现象出现。在技术不到位的时候，两侧双眼皮会呈现不对称的状态，而且缝合线有可能会出现滑脱，使埋线手术失败。

埋线双眼皮通常只适用于年龄较小且眼皮没有松弛的求美者，而对于眼皮脂肪较多或已经出现松弛的求美者来说，是并不适合选择埋线双眼皮手术的，这样最终的美容效果也会大打折扣。