过敏性肠炎的症状主要是腹痛和腹泻。过敏性肠炎也是属于一种肠敏感、肠功能紊乱，临床上称为肠易激综合征。主要是一组以腹痛伴排便异常为表现，排除了器质性病变的肠道功能紊乱性疾病，与胃肠动力学异常、肠敏感、肠道激素失衡，心理、精神障碍等因素有关。

约三分之一的患者对食物不耐受，患者对于一些生理性或非生理性的刺激，如食物、胃肠扩张等反应增强，会出现腹痛、腹胀、排便习惯的改变。腹痛主要表现为脐周或下腹部隐痛、剧痛、绞痛等。大便习惯的改变主要是排便次数增多、排水样便或者是粘液便，一般不会有脓血和鲜血便。