扁桃体发炎，可能会引起一些局部以及全身性的并发症。

如果炎症程度比较重，可能会导致扁桃体本身化脓性感染，还可能导致扁桃体周围炎、扁桃体周围脓肿等局部的并发症，也可能会导致咽旁脓肿、咽后脓肿等。还可以并发急性中耳炎、急性鼻炎、鼻窦炎、急性淋巴结炎等等。如果病情未得到积极、有效的治疗和控制，可能还会导致畏冷、发热，甚至出现持续性的高热。如果扁桃体发炎的状况很频繁、反复发生，还可能会导致全身性的并发症，比如肾炎、心肌炎、关节炎等等。