德尔塔病毒感染后的临床表现和既往毒株无显著差别。大多数患者以肺部表现为主，即以咳嗽、咳痰为主要表现，少数患者可出现发热、乏力症状，部分患者以嗅觉、味觉减退或丧失等为首发表现。少数患者可出现鼻塞、流涕、咽痛、结膜炎，肌痛和腹泻等表现。

重症患者多在发病一周后出现呼吸困难或低氧血症，严重者可快速发展为急性呼吸窘迫综合征、脓毒症休克、代谢性酸中毒、出凝血功能障碍和多器官功能衰竭等疾病。极少数患者还可出现中枢神经系统受累及肢端缺血性坏死等表现。