但是肛瘘主要是指肛周感染形成脓肿后，慢慢形成瘘管，继而形成肛瘘，是一种慢性感染性疾病。而痔疮不是感染性疾病，痔疮主要是因为直肠远端粘膜下及肛管皮肤下，静脉丛屈曲扩张成团而形成的。

　　因此两者在治疗上也是不同的，并且临床表现也不同，肛瘘主要表现为肛周包块、反复流脓等；而痔疮主要表现为便血，及形成血栓时可以引起肛门疼痛、肛门不适等临床表现。