部分肛瘘经过正规处理能得到有效控制，但是有些肛瘘，因为其病因复杂，如克罗恩病引起的肛瘘、外伤或者肿瘤引起的肛瘘或者是多次手术没有痊愈的肛瘘。对于这一类复杂性肛瘘，它的治疗难度会相应增加。

　　患者不用过度紧张，只要经过正规医院的处理，肛瘘都可以得到有效治疗。对于复杂性肛瘘，患者需请权威医生进行检查，明确病因进行治疗。对于继发于其它疾病的肛瘘，需要在原发病得到有效治疗之后，才能够治疗肛瘘，如由于肿瘤引起的肛瘘，一定先分析肿瘤的治疗情况，再分析肛瘘的治疗情况，结合起来才能更好的处理。