甲状舌骨囊肿是以甲状腺发育有关的先天性畸形，是种先天性的疾病。绝大部分甲状腺舌骨囊肿都是良性，因此患者不必太过担心。

　　甲状腺舌骨通常在胎儿6周左右，自行闭锁。如果甲状腺舌骨退化不全，即可形成先天性的囊肿。而如果感染破溃后，则形成甲状腺舌骨瘘。本病多见于儿童，尤其是男性儿童多见。