重症肌无力的最佳治疗方案为药物治疗。常用的方案为胆碱酯酶抑制剂与糖皮质激素连用。糖皮质激素可采用冲击疗法，也可采用小剂量的递增疗法。当糖皮质激素疗效不佳或不能耐受，或者有使用激素的禁忌症时，可给予免疫抑制剂替代治疗。

　　此外合并有胸腺瘤的患者，可采取胸腺切除及胸腺放射治疗。而血浆置换和大剂量的免疫球蛋白注射，也可用于重症肌无力的病人。如果形成肌无力危象，而造成呼吸困难，则应行气管切开及呼吸机辅助呼吸。