卵巢囊肿分为生理性和病理性。生理性原因是黄体囊肿、黄素囊肿、滤泡囊肿，卵巢受雌孕激素影响发生特殊变化，比如局限性呈囊性增大。

　　病理性卵巢囊肿主要是卵巢肿瘤，比如畸胎瘤。

　　生理性囊肿大部分人在五公分以下，而且可以有自愈或自然消失可能性。主要处理方式是三到六个月定期复查。对小部分如果在三个月到六个月复查，囊肿进行性增大或者发生扭转、腹痛症状，要尽早住院手术治疗。

　　早期畸胎瘤也是呈囊性变，可以通过化验肿瘤标志物，判断是上皮性卵巢囊肿，还是生殖性或其它来源的卵巢囊肿，对单个或者双侧直径大于五公分以上的囊肿，要尽早手术治疗。