新生儿化脓性脑膜炎后遗症比较多。多继发于败血症急性起病，后遗症会有硬脑膜下积液、脑积水、脑室管膜炎。还有各种神经功能障碍，包括神经性耳聋、听力障碍、智力障碍、脑性瘫痪，癫痫行为、异常等。

　　早期的诊断是患儿获得早期治疗的前提。通过治疗以后，部分孩子脑积液培养是阴性，临床症状基本消失，可以认为是治愈。但是至于以后，要注意密切观察新生儿一般情况，包括大动作发育以及智力情况。