急性上呼吸道感染最常见的病原体有两大类:
一类是病毒,包括鼻病毒、冠状病毒、腺病毒、流感和副流感病毒,以及呼吸道合胞病毒、埃克病毒等。
另一部分是由细菌引起的,多见于口腔定植菌,如溶血型链球菌、流感嗜血杆菌、肺炎链球菌和葡萄球菌的,偶尔见革兰氏阴性杆菌。