甲减的原因有很多，以原发性的最为常见，其次是垂体性，原发性甲减中，以慢性淋巴细胞性甲状腺炎最为常见。

　　慢性淋巴细胞性甲状腺炎的病因是免疫性原因，所引起甲减。还有亚急性甲状腺炎，病毒感染波及甲状腺，而引起甲状腺发炎，甲减是一过性。

　　还有甲亢碘131治疗后，这种是放射性碘破坏甲状腺而导致甲减，再有甲状腺切除以后也可以引起甲减。

　　还有碘缺乏，可以引起地方性甲状腺肿、甲状腺激素合成障碍。还有先天性疾病，先天性甲状腺发育不全，也可以引起甲减。