无痛胃镜的麻醉一般不会有后遗症。无痛胃镜的麻醉施行方法一般是指静脉麻醉药，通过静脉点滴而注入患者体内，使中枢神经系统受到抑制，患者意识消失而无疼痛感觉的一种病理生理状态。

　　随着麻醉药物的代谢排出体外，从而患者苏醒过来，不会留有后遗症。但是如果患者合并了基础疾病，通过麻醉医师的评估，可能不适合做无痛胃镜的患者，就没必要去做无痛，因为合并心血管或者其它疾病的患者，可能不能耐受无痛，从而发生心血管或者其它的危险和意外。