手足口病，主要是由肠道病毒所引起的。肠道病毒有很多种类型，在我国，三岁以下儿童得手足口病，多是由于柯萨奇病毒a组肠道病毒导致的，常见形式是柯萨奇病毒A16型。

　　其次，还有一种肠道病毒是EV71型。这两型肠道病毒虽然都是RNA病毒，但是在体外的生存能力还是比较强的。

　　此外，在温度为四度的环境下，柯萨奇病毒a组肠道病毒和EV71型肠道病毒不能够生存，存活时间只有1年以上，所以传染性比较强。