胃肠间质瘤的检查中，没有创伤的检查一般会先推荐腹部增强CT。

　　如果是位于肝脏或是位于盆底盆腔部位的间质瘤有可能会增加做磁共振的检查。如果是在检查的过程中发现肿瘤长在胃或者十二指肠、直肠中，肯定会加做胃镜或是超声胃镜、超声肠镜的检查。

　　如果怀疑肿瘤已经发生了远处转移，可能还会加做派特CT的检查，即pet-ct，叫做全身的肿瘤扫描，属于核素检查。

　　一般完成以上几项检查以后可以诊断病人是否是胃肠间质瘤，并且能够进行初步临床分期以及初步治疗方案提示。