喝了藿香正气水头疼可能是药物副作用、外感风寒、过敏性反应等因素造成，需要对症治疗。

1.药物副作用：藿香正气水药物中含有大量酒精，如果服用的药物剂量较大，就会出现酒精中毒，部分患者会出现头痛和手脚麻木症状，需要立刻停止服用药物及时就诊，缓解症状。

2.外感风寒：外出的时候没有做好保暖工作或者外界的温度较低，就会导致寒气入侵体内，需要遵医嘱口服维C银翘片和感冒软胶囊药物治疗。

3.过敏性反应：如果患者本身就属于过敏性体质，服用藿香正气水后，身体出现一系列过敏症状，比如起皮疹和头疼，需要遵医嘱口服氯雷他定片、复方甘草酸苷胶囊等药物治疗。