功能性下丘脑性闭经是一种常见的继发性闭经。是中枢神经系统及下丘脑各种功能和器质性疾病而引起的闭经。在治疗上首先要去除病因，包括积极治疗全身性疾病，提高机体的体质。给予足够的营养。保持标准体重。耐心的给予心理治疗，消除精神紧张和焦虑。要求生育的给予激素治疗、促排卵。

不要求生育的给予雌孕激素序贯疗法，进行补充治疗。