结核杆菌感染多数来自肺内结核病灶，结核菌经淋巴或血液循环引起感染，少数可由胸膜腔邻近的结核灶破溃直接侵犯胸膜，人工气胸或结核性脓胸手术时胸腔污染或并发支气管-胸膜瘘时发生。

脓胸也是人工气胸或手术治疗结核性脓胸的合并症。骨结核或胸壁结核也可侵入胸腔。

结核性脓胸合并混合感染时，由于细菌的超强感染力或继发于胸腔穿刺、置管术的损伤，可发生支气管-胸膜瘘。