新生儿囟门不明显的原因有卤门天生比较小、颅骨重叠、小头畸形等，具体如下：

　　1、囟门天生比较小

　　如果新生儿囟门天生比较小，则家长在观察时会发现囟门不明显。此种情况不需要过度担心，只要新生儿头围正常即可。

　　2、颅骨重叠

　　如果新生儿是顺产分娩，而产妇产道比较狭窄，则新生儿在经过产道时脑部容易受到挤压，导致颅骨重叠，从而出现囟门不明显的现象。

　　3、小头畸形

　　小头畸形是指头部周径低于平均值的3个标准差，该病可导致新生儿前囟以及骨缝过早闭合，进而造成囟门不明显。随着患儿年龄增长，还可出现运动语言发育落后、智力低下等症状。